Biotechnology Journal

Biotechnology Journal

Supporting Information for DOI 10.1002/biot.201400196

Geographic origin is not supported by the genetic variability found in a large living collection of Jatropha curcas with accessions from three continents Fatemeh Maghuly, Joanna Jankowicz-Cieslak, Stephan Pabinger, Bradley J. Till, Margit Laimer

© 2014 Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim

Supplementary Tables and Figure legends

Table S1 List of 907 J. curcas accessions and related species (RS) from 3 different continents, 15 different countries and 53 regions Individual India1 India2 India3 India5 India6 India7 BAAS22_1

Region India India India India India India Icrisat_BAAS

Country India India India India India India India

Continent Asia Asia Asia Asia Asia Asia Asia

BAAS22_5 BAAS38_1 ISC111_2 ISC111_3 ISC111_4 ISC111_5 SBAN24_2 SBAN24_4

Icrisat_BAAS Icrisat_BAAS Icrisat_ISC Icrisat_ISC Icrisat_ISC Icrisat_ISC Icrisat_SBAN Icrisat_SBAN

India India India India India India India India

Asia Asia Asia Asia Asia Asia Asia Asia

SBAN24_6 SBAN24_8 SBAN24_9 SNES19_1 SNES19_2 SNES19_4 SNES19_5 SNES19_6

Icrisat_SBAN Icrisat_SBAN Icrisat_SBAN Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES



SNES19_7 SNES19_8 SNES28_3 SNES28_5 SNES28_6 SNES29_1 SNES29_9 SNES30_1

Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES



SNES30_4 SNES30_6 SNES44_1 SNES44_2

Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES

India India India India

Asia Asia Asia Asia

1

SNES44_3 SNES44_5 SNES44_6 SNES45_3 SNES45_4

Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES

India India India India India

Asia Asia Asia Asia Asia

SNES39_1 SNES39_2 SNES39_3 Down1 Down2 Down3 Down4 Wonogiri

Icrisat_SNES Icrisat_SNES Icrisat_SNES Sleman_D Sleman_D Sleman_D Sleman_D Sleman_D

India India India Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia


UP1 UP4 UP5 UP7 UP8 UP9 UP10 UP11

Sleman_U Sleman_U Sleman_U Sleman_U Sleman_U Sleman_U Sleman_U Sleman_U

Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia Indonesia


UP12_1 UP12_2 UP14 China1 China2 China3 China4 China5

Sleman_U Sleman_U Sleman_U China China China China China

Indonesia Indonesia Indonesia China China China China China


China6 China7 Cver2 Cver4 Cver5 Guinea1 Guinea3 Guinea4

China China Cape Verde Cape Verde Cape Verde Guinea Bissau Guinea Bissau Guinea Bissau

China China Cape Verde Cape Verde Cape Verde Guinea Bissau Guinea Bissau Guinea Bissau

Asia Asia Africa Africa Africa Africa Africa Africa

Guinea5 Sarya5_2 Sarya5_3 Sarya5_4 Sarya5_6 Sarya5_7

Guinea Bissau Sarya Sarya Sarya Sarya Sarya

Guinea Bissau Burkina Faso Burkina Faso Burkina Faso Burkina Faso Burkina Faso

Africa Africa Africa Africa Africa Africa

2

Sarya5_10 Cheffa3 Cheffa4 Cheffa5 Cheffa6

Sarya South Wello South Wello South Wello South Wello

Burkina Faso Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia

Africa Africa Africa Africa Africa

Cheffa8 E1_2 E1_3 E1_12 E1_14 E1_16 E1_17 E2_1

South Wello Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso

Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia

Africa Africa Africa Africa Africa Africa Africa Africa

E2_2 E2_3 E2_5 E2_6 E2_9 E2_19 E3_0 E3_2

Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso



E3_3 E3_29 E4_1 E4_3 E4_8 E4_10 E4_12 E4_14

Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso



E4_16 E4_24 E11_0 E11_1 E11_4 E11_14 E13_7 E14_6

Ataye_JewihaNegeso Ataye_JewihaNegeso Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure



E14_11 E14_18 E14_20 E14_21 E14_23 E15_15

Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure

Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia


3

E15_17 E16_1_1_2 E16_1_1_3 E16_1_1_4 E16_1_1_6

Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure

Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia


E16_1_1_7 E16_1_1_8 E16_1_1_9 E16_1_1_10 E16_1_2_4 E16_1_2_7 E16_1_2_8 E16_1_2_10

Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Dure



E16_1_3_2 E16_1_3_8 E16_4_1 E16_4_2 E16_4_3 E16_4_4 E16_4_5 E16_4_7




E16_4_8 E16_4_9 E16_5_1 E16_5_2 E16_5_4 E16_5_5 E16_6_1 E16_6_2




E16_6_4 E16_6_5 E12_0 E12_3 E12_11 E17_3 E18_0 E18_5

Kalu_Dure Kalu_Dure Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan



E18_6 E18_7 E20_1 E20_10 E20_12 E21_1_2

Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan Kalu_Degan Kewit_Rasa



4

E21_1_3 E21_1_4 E21_1_6 E21_1_8 E21_1_10

Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa



E21_2_3 E21_3_1 E21_3_2 E21_3_4 E21_3_8 E21_4_1 E21_4_2 E21_4_3

Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa



E21_4_4 E21_4_5 E21_4_6 E21_4_7 E21_4_8 E21_4_9 E21_4_10 E21_5_3




E21_5_6 E21_5_8 E21_5_10 E21_6_2 E21_6_4 E21_6_6 E21_6_7 E21_6_9




E21_6_10 E23_1 E23_1_0 E23_1_1 E23_1_2 E23_1_3 E23_1_5 E23_1_7




E23_1_8 E23_1_10 E23_2 E23_2_1 E23_2_2 E23_2_3

Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa Kewit_Rasa



5

E23_2_5 E23_2_7 E23_2_8 E23_3_3 E23_3_4




E23_3_5 E23_3_6 E23_3_7 E23_3_10 E23_4_2 E23_4_4 E23_4_5 E23_4_6




E23_4_7 E23_5_1 E23_5_2 E23_5_3 E23_5_5 E23_5_6 E23_5_7 E23_5_8




E23_5_10 E23_6_4 E23_6_8 E23-6_9 E23_6_10 E26_1_1 E26_1_2 E26_1_3




E26_1_4 E26_1_7 E26_1_9 E26_1_10 E26_2_1 E26_2_3 E26_2_5 E26_2_8




E26_3_1 E26_3_4 E26_3_6 E26_3_7 E26_3_9 E26_4_1




6

E26_4_3 E26_4_6 E26_4_7 E26_4_8 E26_4_9




E26_4_10 E26_5_1 E26_5_2 E26_5_3 E26_5_4 E26_5_5 E26_5_6 E26_5_7




E26_5_9 E26_6_2 E26_6_3 E26_6_5 E26_6_6 E26_6_7 E26_6_8 E26_6_10




E28_1 E28_1_2 E28_1_3 E28_1_4 E28_1_6 E28_1_7 E28_2 E28_2_4




E28_2_5 E28_2_8 E28_3_7 E28_3_10 E28_4_2 E28_4_3 E28_4_6 E28_4_9




E28_4_10 E28_5_7 E28_5_10 E28_6_1 E28_6_10 E28_6_2




7

E28_6_3 E28_6_5 E28_6_7 E28_6_8 E28_6_9




E31_1_1 E31_1_2 E31_1_3 E31_1_5 E31_1_6 E31_1_9 E31_2_6 E31_2_7

Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis



E31_3_1 E31_3_2 E31_3_3 E31_3_5 E31_3_7 E31_3_8 E31_3_9 E31_4_2




E31_4_4 E31_4_6 E31_4_8 E31_4_9 E31_5_5 E31_5_6 E31_6_1 E31_6_2




E31_6_9 E36_1_3 E36_1_4 E36_1_5 E36_2_1 E36_2_2 E36_3_2 E36_3_4




E36_4_3 E36_4_5 E36_4_6 E36_4_7 E36_4_8 E36_5_2

Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis



8

E36_5_4 E36_5_5 E36_5_9 E36_5_10 E36_6_1

Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis



E36_6_6 E36_6_8 E41_1_3 E41_1_5 E41_1_6 E41_1_7 E41_1_8 E41_1_10




E41_2_10 E41_2_3 E41_2_5 E41_2_6 E41_3_2 E41_3_3 E41_3_4 E41_3_5




E41_3_7 E41_3_10 E41_4_7 E41_4_9 E41_5_1 E41_5_3 E41_5_7 E41_6_2




E41_6_6 E43_1_2 E43_1_3 E43_1_7 E43_1_8 E43_1_9 E43_1_10 E43_2_1




E43_2_3 E43_2_4 E43_2_7 E43_2_8 E43_2_9 E43_3_4

Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis



9

E43_3_6 E43_3_8 E43_4_6 E43_4_8 E43_5_5

Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Yohannis



E43_6_8 E43_8 E32_1_3 E32_1_4 E32_1_7 E32_1_8 E32_1_10 E32_2_1

Metema_Yohannis Metema_Yohannis Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin



E32_2_3 E32_2_4 E32_2_6 E32_2_8 E32_2_9 E32_3_1 E32_3_7 E32_3_8

Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin



E32_3_9 E32_4_2 E32_4_6 E32_5_3 E32_6_3 E32_6_7 E32_13 E32_14




E33_2_9 E33_4_3 E33_4_4 E33_4_5 E33_4_8 E33_4_9 E33_5_3 E33_5_4




E33_5_7 E33_5_10 E33_6_1 E33_6_4 E33_8 E33_9

Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin Metema_Shehedin



10

E37_1_2 E37_1_4 E37_1_5 E37_1_6 E37_1_7

Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha



E37_1_9 E37_1_10 E37_2_3 E37_2_6 E37_2_7 E37_4_8 E37_4_9 E37_4_10

Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha



E37_5_1 E37_7 E37_8 E37_9 E38_1 E38_1_2 E38_1_3 E38_1_4




E38_1_8 E38_2_1 E38_2_2 E38_2_4 E38_2_8 E38_2_10 E38_3_7 E38_3_10




E38_4_2 E38_4_4 E38_6_10 E38_7_8 E42_1_1 E42_1_3 E42_1_9 E42_2_6




E42_2_7 E42_4_10 E42_5_2 E42_5_4 E42_5_6 E42_6_5

Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha Metema_AgamWuha



11

E42_6_9 E6_1 E6_11 E6_2 E6_3

Metema_AgamWuha Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y



E7_1 E7_2 E7_3 E7_12 E8_0 E8_1 E8_11 E8_12

Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y Kemise_Y



E8_13 E8_14 E8_16 E8_28 E8_3 E8_8 E8_31 E8_35




E9_6 E9_7 E9_8 E9_9 E9_10 E9_11 E10_14 E10_28




E10_30 Kemise1_1 Kemise1_4 Kemise1_5 Kemise1_6 Kemise1_7 Kemise1_8 Kemise1_9

Kemise_Y Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M



Kemise1_10 Kemise2_3 Kemise2_4 Kemise2_5 Kemise2_6 Kemise2_8

Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M



12

Kemise2_9 Kemise3_1 Kemise3_2 Kemise3_3 Kemise5_1

Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M



Kemise5_3 Kemise5_4 Kemise6_1 Kemise6_2 Kemise6_3 Kemise6_4 Kemise6_5 Kemise6_6

Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M Kemise_M



Kemise6_7 Kemise6_8 R10013_1 R10013_3 R10013_5 GBA2_1 GBA2_2 GBA2_3

Kemise_M Kemise_M Kemise_D Kemise_D Kemise_D Woreda Woreda Woreda



GBA2_5 GBA2_6 GBA2_7 GBA2_8 GBA2_9 GBA2_10 GBA3_1 GBA3_2

Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda



GBA3_3 GBA3_4 GBA5_1 GBA5_2 GBA5_3 GBA5_7 GBA6_1 GBA6_2

Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda



GBA6_4 GBA6_5 GBA6_6 GBA6_7 GBA6_8 GBA7_1

Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda



13

GBA7_2 GBA7_3 GBA7_4 GBA7_5 GBA7_6

Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda



GBA7_7 GBA8_1 GBA8_2 GBA8_4 GBA8_6 GBA8_8 GBA8_9 Mieso4_1

Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda Woreda West Hararghe



Mieso4_3 Mieso4_4 R10010_3 R10010_4 R10010_5 R10010_6 R10010_7 R10010_8

West Hararghe West Hararghe Chreti Chreti Chreti Chreti Chreti Chreti



R10011_1 R10011_2 E22_1_5 E22_1_7 E22_2_1 E22_2_8 E22_3_3 E22_3_4

Chreti Chreti Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit



E22_3_8 E22_6 E24_2 E24_6 E27_1_5 E27_1_7 E27_1_8 E27_1_9

Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit



E27_2_3 E27_2_4 E27_2_5 E27_2_6 E27_2_8 E27_3_1

Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit



14

E27_3_4 E27_3_5 E27_3_8 E27_3_9 E27_4_3

Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit Shoa_Robit



E27_4_6 E27_4_8 E27_5 E27_5_4 E27_5_5 E27_5_6 E27_5_7 E27_5_9




E27_6 E27_6_1 E27_6_2 E27_6_3 E27_6_5 E27_10 E27_11 E27_12




R1002_1 R1002_2 R1002_3 R1002_5 R1003_2 R1003_3 R1003_4 R1003_5




R1004_2 R1004_3 R1004_4 R1005_2 R1005_5 R1006_4 R1006_5 R1007_1




R1007_3 R1008_1 R1008_2 R1008_4 R1009_3 R1009_5

Shoa_Robit Shoa_Zuti Shoa_Zuti Shoa_Zuti Shoa_Jewha Shoa_Jewha



15

R1009_6 R1009_7 R10012_2 R10012_3 R3001_1

Shoa_Jewha Shoa_Jewha Shoa_Jewha Shoa_Jewha Shoa_Fok



R3001_2 R3001_3 R3001_4 R3003_4 R3004_1 R3004_2 R3004_3 R3004_4

Shoa_Fok Shoa_Fok Shoa_Fok Shoa_Fok Shoa_Sodere Shoa_Sodere Shoa_Sodere Shoa_Sodere



Sodere3 Sodere4 Sodere6 Sodere7 Sodere9 Sodere10 R2001_1 R2001_2

Shoa_Sodere Shoa_Sodere Shoa_Sodere Shoa_Sodere Shoa_Sodere Shoa_Sodere Wolita_Sodo Wolita_Sodo



R2002_1 R2002_3 R2002_4 R2003_1 R2003_2 R2003_3 R2003_4 R2004_2

Wolita_Sodo Wolita_Sodo Wolita_Sodo Goffa Goffa Goffa Goffa Goffa



R2004_3 R2004_4 R2005_2 R2005_3 R2005_4 R2005_5 R2005_6 R2005_7

Goffa Goffa Wolita_WachigaMalka Wolita_WachigaMalka Wolita_WachigaMalka Wolita_WachigaMalka Wolita_WachigaMalka Wolita_WachigaMalka



R2006_1 R2006_3 R2007_1 R2007_3 R2007_4 R2008_1

Wolita_WachigaMalka Wolita_WachigaMalka Wolita_Mella Wolita_Mella Wolita_Mella Wolita_Mella



16

R2008_2 R2008_3 R2008_4 R2008_5 R2009_2

Wolita_Mella Wolita_Mella Wolita_Mella Wolita_Mella Wolita_Fango



R2009_3 R2009_4 R2009_5 Turmie1 Turmie2 Turmie3 Ware2 Ware3

Wolita_Fango Wolita_Fango Wolita_Fango SouthOmo_Turmie SouthOmo_Turmie SouthOmo_Turmie Waretiyo Waretiyo



Ware4 Ware5 Ware6 Ware7 Ware9 B1J1 B1J15 B2J16

Waretiyo Waretiyo Waretiyo Waretiyo Waretiyo Busia Busia Busia

Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Ethiopia Kenya Kenya Kenya


B3J14 B3J5 k1J1 k1J2 k1J14 k2J8 K3J1 K3J11

Busia Busia Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega

Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya


K3J12 k3J14 k3J15 k3J17 K3J2 K3J3 k3J5 K3J7

Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega



K4J1 k4J2 k4J3 k4J16 k4J19 k5J5

Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega Kakamega

Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya


17

Renya1_1 Renya1_2 Renya1_3 Renya1_4 Renya1_5

Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced

Kenya Kenya Kenya Kenya Kenya


Renya1_7 Renya1_8 Renya2_1 Renya2_2 Renya2_3 Renya2_4 Renya2_5 Renya2_6

Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced



Renya2_7 Renya2_8 Renya2_9 S1J1 S1J6 S1J12 S1J13 S1J15

Kenya_introduced Kenya_introduced Kenya_introduced Siaya Siaya Siaya Siaya Siaya



S1J16 S4J12 Falou1 Falou2 Falou3 Falou4 Falou6 Falou7

Siaya Siaya Falou Falou Falou Falou Falou Falou

Kenya Kenya Mali Mali Mali Mali Mali Mali


Falou8 Falou9 Mal1 Mal2 Mal3 Mal4 Mal5 Mal6

Falou Falou Ech Ech Ech Ech Ech Ech

Mali Mali Mali Mali Mali Mali Mali Mali


Mal7 Arusha1 Arusha2 Arusha3 Arusha4 Arusha5

Ech Arusha Arusha Arusha Arusha Arusha

Mali Tanzania Tanzania Tanzania Tanzania Tanzania


18

Arusha8 J_curc1 J_curc2 J_curc3 J_curc4

Arusha Las Pilas Las Pilas Las Pilas Las Pilas

Tanzania Mexico Mexico Mexico Mexico

Africa America America America America

J_curc7 J_curc8 Mexico3 Mexico6 Mexico7 MexMAR1 MexMAR2 MexMAR3

Las Pilas Las Pilas Mexico Mexico Mexico Morelia Morelia Morelia

Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico

America America America America America America America America

MexPC1 MexPC2 MexPC3 MexPC4 MexPC5 MexPC6 MexPC7 Brazil1

Puerto Escondido Puerto Escondido Puerto Escondido Puerto Escondido Puerto Escondido Puerto Escondido Puerto Escondido Brazil

Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico Mexico Brazil


Brazil2 Brazil3 Brazil4 Brazil5 2JACS1 2JACS2 2JACS3 HC139_1

Brazil Brazil Brazil Brazil Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay

Brazil Brazil Brazil Brazil Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay


HC139_2 HC139_3 HC139_4 HC139_7 HC139_9 HC139_11 HC139_12 HC139_13

Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay



HC139_14 HC139_15 HC139_16 HC139_17 HC139_18 HC139_20

Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay


America America America America America America

19

HC139_22 HC139_25 HC139_26 HC139_27 HC139_28

Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay Paraguay


America America America America America

















HC139_138 HC139_139 HC139_141 HC139_142 HC139_144 HC139_146



America America America America America America

20

HC139_152 HC139_155 HC139_163 HC139_167 HC139_172



America America America America America

HC139_303 HC139_306 HC139_312 HC139_345 HC139_351 HPSB7_1 HPSB7_3_1 HPSS6_1




HPSS6_2_1 HPSS6_2_2 HPSS6_2_3 JAB JACS1 JACS3 PAY1 PAY3




PAY4 JC_B1_11 JC_B1_12 JC_B1 JC_B1_2 JC_B1_6 JC_B1_9 JH_AR2_5

Paraguay Bolivia Bolivia Bolivia Bolivia Bolivia Bolivia RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca

Paraguay Bolivia Bolivia Bolivia Bolivia Bolivia Bolivia Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina


RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca RS_Catamarca

Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina

JH_AR2_7 JH_AR2_8 JH_AR3 JH_AR3_4 JH_AR5_10 JH_AR5_16 JH_AR5_18 JH_AR5_4 JH_AR5_7 JM_AR13_1 JM_AR14_1 JM_AR14_3 JM_AR9_1 JM_AR10_1

RS_La Riova

21

America America America America America America America America America America America America America America

JM_AR10_4 JM_AR10_5 JM_AR11_3 JM_AR11_4 JM_AR6_2 JM_AR6_5 JM_AR8_3 JM_AR8_4 J_gossypifolia J_podagrica J_multifida Ricinus communis

RS_La Riova RS_La Riova RS_La Riova

Argentina Argentina Argentina

RS_La Riova RS_La Riova RS_La Riova RS_La Riova RS_La Riova RS_Mix RS_Mix RS_Mix

Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Argentina Brazil Indonesia

RS_Mix

Kenya

22

America America America America America America America America America America Asia Africa

Table S2 Population genetic structure (Lynch and Milligan) Hw a

Hb b

Continents

0.1106

0.0158

Countries

0.1088

0.0132

Regions

0.1062

0.0230

a

the mean gene diversity within populations (analogous to Nei's Hs)

b

the average gene diversity among populations (analogous to Nei's Dst),

23

Table S3 Complete list of polymorphisms after sequencing four candidate genes (AF, EU22, EF03 and DQ15). aPosition after sequencing, bPosition-Specific Scoring Matrix (PSSM) diference > 10 indicates a mutation that is more likely to have a damaging effect on protein function, c Sort Intolerant From Tolerant (SIFT) score