0,000 ILMN_188977. 22213. 10. Y. Y. Aatf. 0,654. 0,001. -0,218. 0,000 ILMN_212076. 56321. 11. Y. Y. Arrb2. 0,924. 0,000. -0,066. 0,000 ILMN_218837. 216869.
Figure S5 This table shows all genes found to be 1.5fold regulated in shSLX1 relative to wild type, with an FDR corrected p value < 0.05 The rightmost columns indicate: 1) Whether the magnitude of the log ratio to WT was lower in shSLX1shSLY than in shSLX1 (i.e. correction of the de-regulation) 2) If so, whether the difference between shSLX1SLY and shSLX1 had an FDR corrected p value < 0.05
shSLX1 SYMBOL Aox4 Atp6v1h Fam178b Fhl2 LOC100043347 Slamf9 1110008P14Rik 1700058C13Rik Agpat2 Angptl2 Bmp7 Col20a1 Ctdspl2 Defb21 Lcn2 N dt5 Nudt5 Rapgef4 Chi3l3 Chi3l4 Dennd4b Larp1b Lrriq3 Tmod4 Ambp
L Log2_ratio 2 ti 1,227 0,860 -0,656 0,618 0 671 0,671 1,104 0,648 0,648 0,632 0,632 1,251 0,786 0,702 1,355 0,626 1,473 1 473 0,723 1,692 1,315 -0,715 0 959 0,959 0,640 1,857 0,906
shSLX1shSLY
p(XY) (XY) 0,000 0,000 0,000 0,001 0 000 0,000 0,000 0,005 0,000 0,001 0,017 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0 000 0,000 0,000 0,000 0,044 0 000 0,000 0,049 0,000 0,000
L Log2_ratio 2 ti 0,043 0,264 -0,803 0,055 -0,161 0 161 -0,148 0,520 -0,005 -0,160 -0,078 0,078 -0,066 0,093 0,021 -0,462 0,104 0,094 0 094 0,063 0,034 -0,152 -0,396 0 093 0,093 0,391 -0,370 0,116
Annotation
p(shSLX1) ( hSLX1) SEARCH SEARCH_KEY KEY 0,000 0,000 0,886 0,002 0 000 0,000 0,000 1,000 0,001 0,000 0,024 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 0,000 0 000 0,001 0,000 0,000 0,030 0 000 0,000 0,365 0,000 0,008
ILMN_222582 ILMN_221485 ILMN_217514 ILMN_186128 ILMN 215832 ILMN_215832 ILMN_215754 ILMN_216202 ILMN_222471 ILMN_217418 ILMN_202070 ILMN_202602 ILMN_209312 ILMN_197409 ILMN_217555 ILMN_219674 ILMN_213908 ILMN 213908 ILMN_213156 ILMN_226085 ILMN_196569 ILMN_184356 ILMN 216009 ILMN_216009 ILMN_202332 ILMN_186822 ILMN_218973
Correction
entrez_id t id
Chr. Ch
Mag M
Sig Si
71872 108664 381337 14200 100043347 98365 73737 73388 67512 26360 12162 73368 329506 403172 16819 53893 56508 12655 104183 229541 214048 74435 50874 11699
1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 3 4
Y Y N Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y
Y Y Y Y Y N Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y N Y Y
BC055111 Cela2a Guca2a Ppap2b Abcb1b Gnrhr Hgfac Myl2 4933413G19Rik Hipk2 St3gal5 Actn4 Cyp2a12 Klk1 Klk1b26 Klk1b4 Klk1b5 1 Klk1b9 Lilra6 Mettl9 Pira2 Shank2 Ccl17 Col4a2 F10 Fam70b Jund LOC100045280 Plcg2 Rnf170 Tnfsf13b 1700019J19Rik Cmc1 Fxyd2 Myl3 Ntm
0,715 0,612 1,211 1,079 0,606 0 696 0,696 0,800 1,514 0,851 0,600 0,602 0,915 0,885 1,500 1,752 0,815 1,590 1 90 1,020 0,762 0,771 1,197 0 810 0,810 0,655 0,994 0,687 0,779 -0,766 , 0,817 0,625 0,810 0,762 1,014 0 723 0,723 0,590 0,880 0,632
0,048 0,000 0,000 0,000 0,000 0 000 0,000 0,000 0,000 0,006 0,001 0,002 0,001 0,002 0,000 0,000 0,000 0,000 0 000 0,005 0,000 0,001 0,000 0 000 0,000 0,004 0,000 0,000 0,000 0,000 , 0,020 0,020 0,000 0,000 0,000 0 003 0,003 0,001 0,003 0,004
0,324 -0,082 -0,320 -0,056 -0,021 0 156 0,156 0,093 -0,021 0,090 -0,001 -0,140 0,140 -0,394 -0,103 0,867 2,249 0,077 0,773 0 3 1,046 -0,100 0,335 0,019 0 212 0,212 0,021 -0,006 0,036 -0,092 0,404 , 0,049 -0,074 -0,371 0,141 -0,183 -0,201 0 201 0,089 0,134 -0,215
0,787 0,000 0,000 0,000 0,000 0 001 0,001 0,000 0,000 0,052 0,001 0,000 0,000 0,000 0,101 0,377 0,000 0,016 0 016 0,544 0,000 0,476 0,000 0 056 0,056 0,003 0,000 0,033 0,000 0,000 , 0,034 0,000 0,000 0,000 0,000 0 000 0,000 0,048 0,010 0,001
ILMN_215845 ILMN_216734 ILMN_213266 ILMN_212849 ILMN_212008 ILMN 185817 ILMN_185817 ILMN_218356 ILMN_224025 ILMN_189726 ILMN_201896 ILMN ILMN_219818 219818 ILMN_212299 ILMN_214236 ILMN_196747 ILMN_196712 ILMN_199361 ILMN_196768 196 68 ILMN_196709 ILMN_201549 ILMN_219776 ILMN_189324 ILMN 211643 ILMN_211643 ILMN_220052 ILMN_216595 ILMN_217890 ILMN_198849 ILMN_217403 _ ILMN_203136 ILMN_210061 ILMN_187098 ILMN_184661 ILMN_221740 ILMN 192959 ILMN_192959 ILMN_224097 ILMN_218112 ILMN_184137
242602 13706 14915 67916 18669 14715 54426 17906 71149 15258 20454 60595 13085 16612 16618 18048 16622 13648 18726 59052 18725 210274 20295 12827 14058 272465 16478 100045280 234779 77733 24099 76412 67899 11936 17897 235106
4 4 4 4 5 5 5 5 6 6 6 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9
Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y N Y Y N Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y
N Y Y Y Y Y Y Y N Y Y Y Y N Y Y Y N Y N Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y
Pstpip1 Usp3 Gm1552 LOC100044873 Prep Ube2g2 Aatf Arrb2 B3gntl1 Ccdc57 Ccl5 Fbll1 LOC100044934 LOC100045019 Tmem11 Zmat5 4933437F05Rik 933 3 0 Serpina1d 0610007P08Rik LOC100046232 Nqo2 Pom121l2 Pou6f2 Tgfbi Fhit Fndc3a Gulo Fam186a Gsdmd Hoxc9 Nfe2 Efcab1 Stfa1 4930583I09Rik Strn Tff2
0,710 0,836 0,687 0,829 0,653 0 720 0,720 0,654 0,924 0,698 0,772 0,682 0,690 0,761 0,649 0,612 1,138 0,875 08 0,834 0,716 1,215 0,730 -0 608 -0,608 1,346 1,084 1,189 1,104 1,228 , -0,594 0,908 0,940 0,667 0,732 1 870 1,870 1,018 0,938 0,601
0,000 0,000 0,000 0,000 0,012 0 000 0,000 0,001 0,000 0,000 0,000 0,018 0,003 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0 000 0,000 0,000 0,000 0,002 0 025 0,025 0,000 0,000 0,000 0,000 0,002 , 0,001 0,000 0,000 0,000 0,000 0 000 0,000 0,000 0,000 0,020
-0,273 0,493 -0,071 0,045 0,059 -0,092 0 092 -0,218 -0,066 -0,257 0,076 0,046 0,346 -0,082 -0,195 -0,261 -0,311 0,536 0 36 -0,118 -0,017 -0,147 0,130 -0 572 -0,572 0,290 -0,110 0,275 -0,774 -0,025 , -0,625 -0,036 0,446 -0,077 0,691 0 066 0,066 0,029 0,037 -0,094
0,000 0,733 0,000 0,001 0,014 0 000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,017 0,456 0,000 0,000 0,000 0,000 0,745 0 0,000 0,000 0,000 0,116 1 000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,001 , 1,000 0,000 0,046 0,000 1,000 0 000 0,000 0,000 0,000 0,004
ILMN_215958 ILMN_190457 ILMN_199038 ILMN_215989 ILMN_202422 ILMN 188977 ILMN_188977 ILMN_212076 ILMN_218837 ILMN_208620 ILMN_223765 ILMN ILMN_212715 212715 ILMN_199174 ILMN_221227 ILMN_195453 ILMN_214265 ILMN_218036 ILMN_220294 22029 ILMN_222172 ILMN_201703 ILMN_209434 ILMN_208782 ILMN 197161 ILMN_197161 ILMN_204071 ILMN_192154 ILMN_222375 ILMN_188804 ILMN_212949 _ ILMN_197658 ILMN_222389 ILMN_223992 ILMN_220449 ILMN_216541 ILMN 245739 ILMN_245739 ILMN_219612 ILMN_184393 ILMN_216698
19200 235441 380640 100044873 19072 22213 56321 216869 210004 71276 20304 237730 100044934 100045019 216821 67178 71275 12 20703 76251 100046232 18105 195236 218030 21810 14198 319448 268756 380973 69146 15427 18022 66793 20861 78057 268980 21785
9 9 10 10 10 10 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 13 13 13 13 13 13 14 14 14 15 15 15 15 16 16 17 17 17
Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y N Y Y Y Y Y Y Y Y
Y N Y Y Y Y Y Y Y Y Y N Y Y Y Y N Y Y Y N N Y Y Y Y Y Y Y Y N Y Y Y Y
Thbs2 Arhgap26 St8sia5 Acsl5 AK076554 Gpr120 Pold4 Rps6ka4 Dusp21 Gm14525 Gm14594 Gm5168 Gm5935 LOC382213 mt-Nd5 AK039094 C f2 Cgef2-pending LOC236371 scl0001883.1_112
1,011 0,941 0,768 0,945 0,762 1 099 1,099 0,793 -0,718 -0,606 -0,800 -1,120 1,120 -1,001 -0,861 -1,212 0,969 0,732 0,642 06 2 0,715 0,670
0,000 0,000 0,000 0,029 0,000 0 000 0,000 0,000 0,001 0,034 0,048 0,000 0,000 0,003 0,000 0,018 0,000 0,000 0 000 0,000 0,000
-0,187 -0,001 0,053 -0,161 -0,195 -0,101 0 101 -0,319 -0,583 0,296 0,285 -0,373 0,373 -0,477 -0,618 -0,826 0,750 -0,233 0,246 02 6 0,301 0,054
0,000 0,000 0,000 0,029 0,000 0 000 0,000 0,000 1,000 0,001 0,038 0,338 1,000 1,000 1,000 1,000 0,000 0,078 00 8 0,012 0,000
ILMN_213253 ILMN_201922 ILMN_218246 ILMN_189230 ILMN_206634 ILMN 222251 ILMN_222251 ILMN_233673 ILMN_221814 ILMN_222304 ILMN_192739 ILMN ILMN_224045 224045 ILMN_232052 ILMN_235895 ILMN_200813 ILMN_194230 ILMN_204680 ILMN_201828 201828 ILMN_199291 ILMN_193472
21826 71302 225742 433256 208449 107221 69745 56613 73547 100039120 666096 382275 546282 17721
17 18 18 19 19 19 19 19 X X X X X X MT
115
Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y
Y Y Y Y Y Y Y N Y Y N N N N N Y N Y Y 111
= Slx/Slxl1 = Slx/Slxl1 = Slx/Slxl1 = Slx/Slxl1 = Slx/Slxl1
91
